zbierka lichenizovaných húb

• zakladatelia: I. Pišút, A. Lackovičová, r. 1990
• počet položiek: ca 14 100
• počet krajín pôvodu: 50
• počet zberateľov: 146
• významné zbery:
  - A. Vězda: Lichenes selecti exsiccati, č. 2101-2500 (v tom 18 izotypov prevažne tropických a exotických druhov, 1 izolektotyp, 5 topotypov)
  - A. Vězda: Lichenes rariores exsiccati (26 položiek) - Lichenes selecti exsiccati Upsaliensis (147 položiek)
  - Feige et Lumbsch: Umbilicariaceae exsiccati (60 položiek)
  - H. Kashiwadani: Lichenes minus cogniti exsiccati (144 položiek)
  - herbár A. Vězdu - 78 rôznych duplikátov (v tom 1 isotypus, 1 topotypus)
  - Wei: Lichenes sinenses exsiccati (50 položiek) - Obermayer: Lichenotheca graecenses (731 položiek) - Follmann: Lichenes exsiccati selecti a museo hisotriae naturalis casselensi editi (150 položiek) - Tonsberg: Lichenes isidiosi et sorediosi (50 položiek)

zbierka nelichenizovaných húb

micromycéty

• zakladateľ: C. Paulech
• počet položiek: ca 15 700
• krajina pôvodu: Slovensko
• zberatelia: K. Bacigálová, C. Paulech, P. Paulech
• významné zbery: 4756 položiek Erysiphales od C. Paulecha k dielu Flóra Slovenska X/1 Erysiphales
• 2 holotypy

makromycéty

• zakladateľ: A. Janitor
• počet položiek: 6 500
• krajina pôvodu: Slovensko
• zberatelia: S. Adamčík, V. Kučera, P. Lizoň
• 2 holotypy, 4 epitypy

zbierka machorastov

• zakladateľ: A. Kubinská, r. 1990
• počet položiek: ca 2850
• krajiny pôvodu: Slovensko, Česko, Rakúsko, Rusko, Švédsko, Taliansko
• počet zberateľov: 13
• významné zbery: V. Peciar Bryotheca Slovenica 233 položiek, J. Duda 616 položiek zo Slovenska

ZBIERKA SINÍC A RIAS

• zakladateľ: F. Hindák
• počet položiek: ca 5800
• fixovaný materiál siníc a rias, trvalé preparáty rozsievok, živé kultúry siníc a rias