Projektová činnosť

Medzinárodné

Ekologické a geografické vlastnosti a hlavné migračné cesty inváznych rastlín v pohraničnej oblasti Ukrajiny a Slovenska
Ecological and geographical peculiarities and main migration ways of invasive plant species in the border area of Ukraine and Slovakia
Program: Bilaterálne – iné
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Májeková Jana PhD.
Anotácia: Projekt je zameraný na objasnenie hlavných faktorov dôležitých v šírení inváznych druhov v pohraničnej oblasti Ukrajiny a Slovenska. Tieto údaje budú tvoriť vedecký podklad monitorovania inváznych druhov a kontroly ich rozšírenia.Výsledkom spoločného ukrajinsko-slovenského projektu bude vytvorenie ekologických, cenologických a geografických vlastností inváznych druhov na pohraničnom území Ukrajiny a Slovenska a po prvýkrát budú hodnotené trendy šírenia a hlavné migračné cesty inváznych druhov v regiónoch.
Doba trvania: 6.4.2017 – 31.12.2019
Hľadanie tolerantných odrôd – fenotypovanie na úrovni rastliny a bunky
The quest for tolerant varieties – Phenotyping at plant and cellular level
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Salaj Terézia DrSc.
Anotácia: Projekt je zameraný na štúdium fyziologických, biochemických a štruktúrnych spektov somatickej embryogenézy. Somatická embryogenéza je vývin embryí zo somatických buniek rastlinného organizmu v podmienkach in vitro a zahŕňa niekoľko etáp: indukcia embryogénnych kultúr, dozrievanie somatických embryí, ich klíčenie a prenos regenerovaných rastlín do pôdy. Každá z týchto etáp sa bude detailne študovať s cieľom optimalizácie. Pri indukcii sa sústredíme najmä na štúdium vplyvu živných médií a explantátov, Štruktúru somatických embryí budeme sledovať na úrovni svetelnej mikroskopie. Embryogénne kultúry sa budú udržiavať v in vitro podmienkach na pevných alebo v tekutých médiách (suspenzné kultúry) alebo metódou kryokonzervácie v tekutom dusíku pri -196 °C.Dozrievanie somatických embryí je dôležitý krok, ktorý vedie k regenerácii celej rastliny. Cieľom projektu je tiež optimalizácia dozrievania somatických embryí a regenerácie rastlín (somatických semenáčov). Dôležitá úloha pripadá štúdiu a porovnávaniu embryogénnych a neembryogénnych pletív na úrovni proteomiky za účelom hlbšieho pochopenia mechanizmov vedúcich k indukcii procesu somatickej embryogenézy.
Doba trvania: 22.5.2014 – 21.5.2018
Konverzia poznatkov na zlepšenie riadenia európskych pobrežných ekosystémov a služieb – COST
Knowledge conversion for enhancing management of European riparian ecosystems and services
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Šibíková Petrášová Mária PhD.
Doba trvania: 9.11.2017 – 8.11.2021
iPLANTA – Modifikácia rastlín na produkciu interferujúcej RNA
Modifying plants to produce interfering RNA
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Moravčíková Jana PhD.
Anotácia: Moderný výskum identifikoval vysoký potenciál mäsožravých rastlín pre biotechnologické využitie. Regulačné mechanizmy prebiehajúce v biologických a metabolických procesoch v týchto rastlinách však doteraz nie sú objasnené, pričom dôležitú úlohu v týchto procesoch zohrávajú rôzne typy malých RNA. Tieto molekuly regulujú rôzne aspekty rastlinných vývinových procesov a podieľajú sa aj na regulácii odpovede rastlín voči environmentálnym stresom. Projekt je zameraný na izoláciu a analýzu týchto molekúl v rastlinách rodu Drosera. Východiskom budú izolačné kity a dostupné protokoly, avšak pre problematickosť pletív týchto rastlín bude potrebná optimalizácia postupov. Získané protokoly pre izoláciu a analýzy malých RNA sú nevyhnutným predpokladom pre výskum regulácie jednotlivých procesov v mäsožravých rastlín akými sú trávenie koristi či získavanie živín, odpovede na environmentálny stres.
Doba trvania: 27.10.2016 – 26.10.2020
NNEXT – Nepôvodné druhy drevín pre európske lesy – skúsenosti, riziká a možnosti
Non-native tree species for european forests – experiences, risks and opportunities
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kormuťák Andrej DrSc.
Anotácia: Introdukcia cudzokrajných druhov lesných drevín do geografických oblastí Európy má v rámci lesníckej praxe už dlhšiu tradíciu. Začiatky tejto introdukcie siahajú do 18. storočia, kedy vznikla silná požiadavka na prírodné zdroje pre potreby prebiehajúcej industrializácie Európy. V súčasnosti sa pozornosť sústreďuje skôr na produkciu biomasy a sekvestráciu uhlíka, ako aj na možnosti zvýšenia adaptačného potenciálu lesov k dlhodobým klimatickým zmenám pomocou cudzokrajných drevín. Za účelom určenia ich potenciálu v najširšom slova zmysle, vznikla diskusná platforma pre špecifikáciu tohto potenciálu.
Doba trvania: 3.6.2014 – 13.5.2018
Optimalizácia podmienok pre in vitro množenie a kultiváciu netradičných odrôd ovocných lián Actinidia arguta a Schisandra chinensis (ukrajinský výber)
The optimization of the conditions for in vitro reproduction and cultivation of non-traditional fruit lianes Actinidia arguta and Schisandra chinensis cultivars (Ukrainian selection)
Program: Bilaterálne – iné
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Libiaková Gabriela CSc.
Anotácia: Projekt otvorí spoluprácu medzi ústavmi v oblasti mikropropagácie rastlín a podporí úroveň daného výskumu. Realizácia projektu umožní úspešne množiť a kultivovať druhy s vysokým vplyvom na ľudské zdravie (Actinidia arguta a Schizandra chinensis), s komerčným efektom a sociálno-ekonomickým významom.
Doba trvania: 6.4.2017 – 6.4.2019
Pozoruhodné prvky lichenobioty významných biotopov Slovenska a Českej republiky projektu SAV-AV ČR 16-07
Remarkable elements of lichenbiota of important biotopes of Slovakia and the Czech Republic (SAV-AV ČR 16-07
Program: Medziakademická dohoda (MAD)
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Košuthová Alica PhD.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2018
Príspevok BÚ SAV k medzinárodnému projektu Millenium Seed Bank
Contribution of IB SAS to the international project Millenium Seed Bank
Program: Iné
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Kučera Jaromír PhD.
Anotácia: Medzinárodný projekt Millennium Seed Bank Partnership (predtým Millennium Seed Bank projekt), zameraný na ochranu rastlín je koordinovaný Kráľovskou botanickou záhradou v Kew (Anglicko). Projekt začal roku 1996, po získaní grantu Millennium Commission v roku 1995 a teraz sídli v budove Wellcome Trust Millenium ktorá sa nachádza v oblasti Wakehurst Place, West Sussex. Projekt je najväčším ex situ záchranným programom na svete. Zameraním projektu je globálna ochrana biodiverzity rastlín, hlavne tých ktoré čelia hrozbe vyhynutia. Semená sú uchovávané v semenných bankách ako poistka proti riziku vyhynutia v ich prirodzenom prostredí. Vďaka spolupráci s 80 partnerskými krajinami z celého sveta (Botanický ústav SAV spolupracuje na projekte od roku 2006), boli úspešne zozbierané a uskladnené semená z viac ako 13% všetkých voľne rastúcich rastlinných druhov sveta. Cieľom projektu je do roku 2020 uskladniť semená z 25% (75 000 druhov) voľne rastúcich druhov rastlín sveta. Prioritne sa zbierajú semená z ohrozených, endemických druhov rastlín, pôvodných príbuzných druhov poľnohospodárskych plodín a oblasti najviac ohrozené zo stále narastúcim vplyvom ľudskej činnosti, vrátane využívania pôdy a zmeny klímy.
Doba trvania: 1.1.2007 – 31.12.2020
Reštitúcia jesetera malého v rakúskom úseku Dunaja – LIFE
Restoration of sterlet populations in the Austrian Danube – LIFE
Program: LIFE
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Pekárik Ladislav PhD.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2021
NATURAsat – Softvérové nástroje na monitorovanie biotopov NATURA 2000 satelitnými snímkami
Software tools for monitoring NATURA 2000 habitats by satellite images
Program: European Space Agency (ESA)
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Šibíková Petrášová Mária PhD.
Anotácia: Cieľom projektu je vytvorenie softwéru, ktorý bude automaticky a poloautomaticky identifikovať, klasifikovať a monitorovať biotopy Natura 2000 pomocou satelitných snímok Sentinel-1 a Sentinel-2 a ich kombinácie. S použitím dynamickej segmentácie a adekvátnej kalibrácie vytvorenej na základe reálnych dát, databáz a expertných skúseností bude činnosť monitorovania biotopov zautomatizovaná a ponúknutá širokému spektru užívateľov od štátnej ochrany prírody až po súkromnú sféru. Presah využitia výsledného projektu do európskeho priestoru je zabezpečený definíciou siete Natura 2000, ktorá predstavuje sústavu chránených území členských krajín Európskej únie s hlavným cieľom zachovania prírodného dedičstva. Projekt predstavuje aplikovaný výskum ktorý prepája akademické prostredie s praxou. Jeho výsledky majú potenciál byť jedinečným spojením metód numerickej a aplikovanej matematiky, botaniky a ekológie s diaľkovým prieskumom zeme a využitím dát európskej vesmírnej agentúry.
Doba trvania: 1.12.2017 – 30.11.2019
Somatická embryogenéza vybraných druhov ihličnatých drevín: indukcia embryogénnych pletív, ich udržiavanie, maturácia somatických embryí a regenerácia rastlín
Somatic embryogenesis in selected conifer species: initiation of embryogenic tissues, their maintenance, maturation of somatic embryos and plantlet regeneration
Program: Medziakademická dohoda (MAD)
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Salaj Terézia DrSc.
Anotácia: Somatická embryogenéza je proces diferenciácie embryí zo somatických buniek rastlinného organizmu v podmienkach in vitro. Pri ihličnatých drevinách tento proces zahŕňa niekoľko štádií: indukcia embryogénneho pletiva, udržiavanie embryogénnych pletív, dozrievanie somatických embryí a regenerácia rastlín (somatických semenáčov). Každé štádium vyžaduje špecifické podmienky a je ovplyvnené viacerými faktormi.Cieľom predloženého návrhu je študovať individuálne štádiá somatickej embryogenézy, predovšetkým vplyv vývinového štádia primárnych explantátov, účinky rastových regulátorov a tiež osmotický potenciál kultivačného média. Druhy Abies alba, Pinus sylvestris a Pinus nigra budú zahrnuté do experimentov
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2018
Stresom-indukovaná expresia arabinogalaktanov a obranné proteíny v súvislosti s iniciáciou androgenézy
Stress-inducible expression of arabinogalactans and defence-related proteins in relation to androgenesis initiation
Program: Medziakademická dohoda (MAD)
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Moravčíková Jana PhD.
Anotácia: Porozumenie mechanizmu vedúceho k rastlinnej ebryogenéze za indukovateľných stresových podmienok (napr. teplota a/alebo osmotický stress) na molekulárnej úrovni je rozhodujúce pre vylepšenie plodín. Aby sme prekonali rezistenciu genotypov k mikrosporovej embryogenéze (ME) v podmienkach in vitro, je dôležité identifikovať selekčné markery pre responzivitu/rekalcitranciu. Dobrými kandidátmi sa zdajú byť proteíny spojené s patogenézou (PRs, PR-3 chitinázy) zahrnuté v rastlinnej obrane voči (a)biotickému stresu s arabinogalaktanmi (AGPs), ktoré pravdepodobne fungujú pri bunkovom delení, diferenciácii a vývinu. Cieľom projektu je charakterizovať PR3 a AGPs vo vzťahu k efektívnosti ME v raži (Secale cereale L.).
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2018
Úloha Clavariaceae (huby) v travinných ekosytémoch
Role of Clavariaceae (fungi) in grassland ecosystems
Program: Bilaterálne – iné
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Adamčík Slavomír PhD.
Doba trvania:
DNAqua-Net – Vývoj nových genetických nástrojov na hodnotenie stavu bioty vodných ekosystémov Európy
Developing new genetic tools for bioassessment of aquatic ecosystems in Europe
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čiampor Fedor PhD.
Web stránka projektu: http://www.cost.eu/COST_Actions/ca/CA15219, http://www.dnaqua.net
Doba trvania: 20.10.2016 – 19.10.2020

Národné

Aktivácia, regulácia a kontrola bunkových mechanizmov v suspenznej kultúre a intaktných rastlinách tabaku elicitovaných mykotoxínmi húb rodu Fusarium
Activation, regulation and control of cellular mechanisms in suspension culture and intact tobacco plants elicited with mycotoxins of genus Fusarium
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Repka Vladimír CSc.
Anotácia: Z pohľadu potravinovej bezpečnosti sa pozornosť sústredila predovšetkým na štúdium vplyvov mykotoxínov na biologickú aktivitu buniek teplokrvných živočíchov. V poslednom období sa začína skúmať vplyv mykotoxínov aj na rastliny, a to najmä na agronomicky zaujímavé. Cieľom projektu je fyziologická, biochemická a molekulová analýza bazálnych mechanizmov buniek rastliny tabaku exponovaných rôznym typom fuzariotoxínov. Budeme sledovať anatomicko-morfologické zmeny elicitovaných buniek, úlohu reaktívnych foriem kyslíka (ROS) v procese percepcie a farmakologickej modulácie odpovede buniek na elicitáciu mykotoxínmi. Zameriame sa na komparatívnu analýzu signálnych a regulačných kaskád zahrnutých v odpovedi buniek na rôzne fuzariotoxíny. Zároveň budeme sledovať expresiu génov a proteínov, ako aj aktivitu enzýmov zodpovedných za aktiváciu, reguláciu a kontrolu odpovede rastlinnej bunky na elicitáciu mykotoxínmi, čo prinesie nové poznatky v oblasti pochopenia principiálnych mechanizmov vo vzťahu rastlina-biotický stres.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Bioekologická štúdia taxónov rodu Soldanella sekcia Soldanella (Primulaceae) na území Karpát, Hercýnskych pohorí a Východných Álp
Bioecological study of the genus Soldanella section Soldanella (Primulaceae) in the Carpathians, the Hercynian Mts. and Eastern Alps
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Slovák Marek PhD.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
Biosystematické štúdium karpatsko-panónskych zástupcov rodu Sesleria (Poaceae)
Biosystematic study of Carpatho-Pannonian representatives of the genus Sesleria (Poaceae)
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Majerová Monika PhD.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
Cyanobaktérie a sprievodné riasy pri tvorbe recentných sladkovodných stromatolitov
Cyanobacteria and accompanying algae in formation of recent freshwater stromatolites
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Hindáková Alica PhD.
Anotácia: Hlavným vedeckým cieľom projektu je štúdium biodiverzity dominantných cyanobaktérií tvoriacich recentné stromatolity na Slovensku. Na základe predchádzajúcich štúdií vieme, že tieto špecifické kalcifikované kolónie pozostávajú predovšetkým z cyanobaktérií rodu Rivularia (R. haematites), ďalej Calothrix, Scytonema, Stigonema a tiež aj iných oscilatoriálnych druhov. Materiál priebežne odoberáme z recentných (živých) travertínových lokalít na Slovensku. Molekulárne analýzy vzoriek mikroorganizmov a subkultúr upresnia doterajšie taxonomické zaradenie založené na morfologických znakoch. Získané molekulárne dáta sa budú dať porovnať s dátami v rôznych európskych databázach. Našu pozornosť upriamime aj na sprievodné cyanobaktérie (napr. rodov Chroococcus, Merismopedia, Leptolyngbya, Heteroleibleinia, Nostoc) a riasy (rozsievky, chlorokokálne a vláknité zelené riasy) recentných stromatolitov. Materiál fixujeme formaldehydom, spolu s mikrofotografiami a trvalými preparátmi budú slúžiť na determináciu, dokumentáciu a na porovnávacie účely. Získané výsledky budeme priebežne prezentovať na domácich a zahraničných sympóziach, konferenciách a publikovať vo vedeckých časopisoch. Lokality s výskytom recentných sladkovodných stromatolitov patria medzi ohrozené biotopy, sú veľmi citlivé na eutrofizáciu a ľudské činnosti, preto ich ochrana je vysoko aktuálna.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
Distribučný potenciál rôznych trofických skupín húb v Európe
Distribution potential of different fungal trophic groups in Europe
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Adamčík Slavomír PhD.
Doba trvania: 1.7.2016 – 30.6.2020
Diverzita a disperzia v metapopuláciách a metaspoločenstvách malých vodných biotopov
Diversity and dispersal in metapopulations and metacommunities of small aquatic biotopes
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čiamporová – Zaťovičová Zuzana PhD.
Anotácia: Projekt je zameraný na výskum nedostatočne poznaných ekosystémov malých vodných biotopov, mimoriadne významných z pohľadu biodiverzity. Logicky nadväzuje na predchádzajúce projekty riešiteľov. Podstatne rozšíri existujúci súbor dát o spoločenstvách prirodzených malých vodných biotopov nížin a horských oblastí a vygeneruje nové dáta z antropogénne narušených biotopov, doplnené o robustné environmentálne údaje. Modelovými organizmami budú makrofyty, mäkkýše, zooplanktón a vodný hmyz pre ich indikačnú hodnotu, odlišné ekologické nároky a funkcie v trofických vzťahoch. Hlavným cieľom je spoznanie zákonitostí biologickej diverzity malých vodných biotopov, s dôrazom na 1) porovnanie dôležitosti rôznych typov biotopov pre zachovanie biodiverzity, 2) posúdenie významu disperzie a vlastností habitatu pre štruktúru metaspoločenstiev a 3) posúdenie miery konektivity v rámci metapopulácií modelových druhov. Naplnenie cieľov prispeje k efektívnej ochrane malých vodných ekosystémov – dôležitého prvku životného prostredia.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Diverzita a klasifikácia európskej travinno-bylinnej vegetácie
Diversity and classification of European grassland vegetation
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Janišová Monika PhD.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
DNA Barkoding Elmidae – využitie molekulárnej taxonómie v poznaní biodiverzity vodných chrobákov
DNA Barcoding Elmidae – application of molecular taxonomy for description of aquatic beetles biodiversity
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čiampor Fedor PhD.
Anotácia: Chrobáky hrajú kľúčovú úlohu vo fungovaní ekosystémov a sú dôležité pre monitorovanie dopadov environmentálnych zmien. Aj keď sú intenzívne študované, identifikácia mnohých druhov je často problematická. Vytvorenie robustnej databázy DNA barkódov druhov umožní riešiť tento problém. Hlavným zdrojom DNA barkódov je projekt Barcode of Life, kde je v súčastnosti ca. 4,5 milióna sekvencií. Z čeľade Elmidae ich je 464, no aj tie predstavujú len nepatrný zlomok známej druhovej diverzity (asi 30 z 1500 druhov). Cieľom projektu je taxonomické spracovanie bohatého materiálu Elmidae z celého sveta, analýza nových DNA barkódov (min. 1000 sekvencií), porovnanie taxonómie s využitím klasických (morfológia) a molekulárnych postupov (vyhodnotenie potenciálu DNA dát pre taxonómiu čeľade), deskribcia nových taxónov, stanovenie fylogenetických vzťahov študovaných rodov v rámci čeľade, analýza vzťahov genetickej variability a druhovej diverzity a zhodnotenie možností využitia DNA barkódov Elmidae v praxi.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
Druhová bohatosť synúzie vyšších rastlín bukových lesov pozdĺž výškového gradientu
Species richness of vascular plants in undestory of beech forests along altitudinal gradient
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Valachovič Milan CSc.
Anotácia: Bukové lesy patria na Slovensku k najrozšírenejším lesným typom spoločenstiev s významným prírodovedným, ale i ekonomickým významom. Druhová bohatosť synúzie vyšších rastlín pozdĺž výškového gradientu vykazuje špecifický priebeh, odzrkadľujúci najmä silnú konkurenčnú schopnosť buka v optime jeho výskytu. Predkladanýprojekt sa zameria na i) detailné poznanie priebehu vzťahu medzi nadmorskou výškou a druhovou bohatosťou v rôznych priestorových mierkach a ii) zistenie faktorov, ktoré tento vzťah podmieňujú.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Dynamika antropicky ovplyvnených biotopov nelesnej vegetácie v procese ekologickej obnovy
Dynamics of human-altered non-forest habitats in the process of ecological restoration
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Škodová Iveta PhD.
Anotácia: Mnohé poloprírodné travinno-bylinné biotopy sú v rámci celej Európy v súčasnosti v nepriaznivom stave v dôsledku sukcesných zmien, ku ktorým dochádza najmä po opustení obhospodarovania. Projekt je zameraný na testovanie rôznych manažmentových zásahov zameraných na obnovu polosuchých, mezofilných a slatinných travinno-bylinných biotopov. Venuje sa testovaniu nových metód na elimináciu šírenia nežiadúcich expanzívnych druhov tráv v rôznych ekologických podmienkach. Zameriava sa aj na vyhodnotenie zmien vybraných nelesných biotopov po veľkoplošnej obnove. Jedným z cieľov je tiež sledovanie časových zmien a dynamiky vybraných nelesných biotopov antropogénneho pôvodu a stanovenie trendov vývoja travinno-bylinnej vegetácie. Projekt logicky nadväzuje na viaceré projekty venované travinno-bylinnej vegetácii na Slovensku (SK0115, VEGA 2/0181/09, VEGA 2/0099/13), v rámci ktorých bola založená sieť terénnych experimentov zameraných na stanovenie vplyvu hospodárenia na druhové zloženie a diverzitu vegetácie.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Flóra Slovenska – čeľaď Asteraceae (1. časť): biosystematické štúdium kritických taxónov
Flora of Slovakia – Asteraceae family (first part): biosystematic study of critical taxa
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Mereďa Pavol PhD.
Anotácia: Projekt je zameraný na taxonomickú a chorologickú revíziu vybraných zástupcov čeľade Asteraceae na Slovensku, resp. v širšom stredoeurópskom priestore. Hlavným výstupom bude ďalšia zo sérií monografií diela Flóra Slovenska, konkrétne zväzok VI/2 (1. časť). Vzhľadom na veľké druhové bohatstvo čeľade na území Slovenska bude v predkladanom projekte riešených prvých 5 tribusov čeľade, menovite Anthemideae, Astereae, Caleduleae, Gnaphalieae a Senecioneae (spolu cca 50 rodov a 165 druhov). Každý taxón bude podrobne charakterizovaný z hľadiska nomenklatúry, morfológie, karyológie, ekológie a chorológie. Súčasťou diela budú aj určovacie kľúče (v slovenčine aj angličtine), originálne perokresby rastlín a mapy rozšírenia taxónov na Slovensku. Špeciálna pozornosť bude v rámci menovaných tribusov venovaná taxonomicky komplikovaným skupinám rodov Achillea, Aster s. l., Senecio s. l., Solidago a Tephroseris, kde plánujeme hlbšie systematické, biogeografické a evolučné štúdie publikované v osobitných publikáciách.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Funkčná a taxonomická diverzita mokradí a ich vzťah k ekosystémovým procesom
Functional and taxonomic diversity of wetlands and their relationship to ecosystem processes
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Hrivnák Richard PhD.
Anotácia: Funkčná diverzita predstavuje jednu zo súčastí biodiverzity a vyjadruje rozsah funkcií, ktoré daná skupinaorganizmov v ekosystéme zastáva. Vzťah medzi funkčnou a tradične využívanou taxonomickou diverzitou je voväčšine ekosystémov takmer úplne neznámy. Predložený projekt sa zaoberá funkčnou diverzitou mokradnýchspoločenstiev a jej vzťahom k diverzite taxonomickej a k ekosystémovým procesom. Pri riešení projektu sachceme zamerať na tri dôležité funkčné charakteristiky mokradných ekosystémov: rozklad organickej hmoty,primárnu produktivitu a invazibilitu. Ako modelový systém pre náš výskum využijeme spoločenstvá vodnýchorganizmov osídľujúcich malé vodné nádrže s cieľmi:1) Posúdiť význam vplyvu prostredia a diverzity (funkčnej a taxonomickej) na ekosystémové procesy2) Zhodnotiť reakciu taxonomickej a funkčnej diverzity na antropické vplyvy
Doba trvania: 1.7.2017 – 30.6.2021
ROLOFSYTS – Funkčná analýza synaptotagmínov so zreteľom na odpovede rastlín na environmentálne stresy
Functional analysis of synaptotagmins in responses of plants to environmental stresses
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Doc. RNDr. Jásik Ján CSc.
Anotácia: Výnos poľnohospodárskych plodín je vo veľkej miere závislý od ich tolerancie na vplyvy okolitého prostredia, vrátane zasolenia. V minulosti sme ukázali, že synaptotagmín 1 (AtSYT1) najviac exprimovaný arábovkový ortológ dobre známych senzorov vápnika v živočíšnych neurónoch je zapojený do odpovede na abiotické stresy. Všeobecným cieľom tohto projektu je odhaliť mechanizmy, ktorými AtSYTs regulujú reakcie na zasolenie a ďalšie stresy. Chceme charakterizovať expresiu AtSYTs génov, popísať fenotyp AtSYTs mutantov, študovať subcelulárnu lokalizáciu AtSYTs proteínov a podrobnejšie vnútrobunkovú dynamiku AtSYT1 proteínu. Navyše vykonáme funkčnú analýzu interakcie, ktorú sme objavili pomocou kvasinkového dvoj hybridného testu, a ktorá spája AtSYT1 s MAP kinázovou kaskádou. Výsledky štúdií prispejú k celkovému pochopeniu otázky, ako je membránový transport zapojený do stresových reakcií.
Doba trvania: 1.6.2017 – 30.6.2021
Hybridné roje borovice lesnej a borovice horskej-kosodreviny na Slovensku
Hybrid swarms of Scots pine and mountain dwarf pine in Slovakia
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kormuťák Andrej DrSc.
Anotácia: Projekt je zameraný na experimentálne overenie hybridologických vzťahov medzi borovicou lesnou (Pinus sylvestris L.) a borovicou horskou-kosodrevinou (P. mugo Turra). V rámci ich predpokladaných hybridných rojov na severnom Slovensku sa určí rozsah introgresívnej hybridizácie s oboma vyššie uvedenými rodičovskými druhmi. Okrem klasických postupov umelej hybridizácie sa počíta aj s využitím chloroplastovej DNA (cpDNA) pri verifikácii získaných medzidruhových i vnútrodruhových hybridov uvedených borovíc. Miera genetickej divergencie medzi hybridnými rojmi a prirodzenými populáciami oboch rodičovských druhov sa určí na základe analýzy ich genetickej štruktúry pomocou cpDNA a mitochondriálnej DNA (mtDNA). Cieľom projektu je potvrdiť hybridný charakter predpokladaných hybridných rojov na lokalitách v Zuberci – Medzi Bormi, Suchej Hore , a Terchovej-Sokolí ako vzácnych endemitov na našom území.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2019
dyNatura2000sat – Identifikácia a monitoring biotopov Natura 2000 pomocou dynamickej segmentácie satelitných obrazov
Identification and monitoring Natura 2000 habitats by dynamic segmentation of satellite images
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Šibík Jozef PhD.
Anotácia: Projekt má za cieľ vybudovanie nových metód výskumu v oblasti botaniky, ochrany prírody a matematického a počítačového modelovania, ktoré budú slúžiť na presnú lokalizáciu a klasifikáciu biotopov Natura 2000 ako aj na monitorovanie ich dynamických zmien, s využitím satelitných dát a novovytvorených špecializovaných softvérov na spracovanie obrazu. Lokalizácia, klasifikácia a dynamické časopriestorové monitorovanie biotopov Natura 2000 bude založené na nových metódach filtrácie, segmentácie a trekingu radarových (SAR) dát z družice Sentinel-1, multispektrálnych obrazových dát z družice Sentinel-2 a ich kombinácie. Softvér na spracovanie obrazu umožní presnú lokalizáciu biotopov Natura 2000 v statických a dynamických družicových dátach s presnosťou danou pixelovým rozlíšením obrazu. Novovytvoreným softvérom budeme môcť spojite monitorovať dynamiku biotopov Natura 2000, s možnosťou okamžitej detekcie náhlych zmien v chránených územiach. Nové metódy a softvér budú vyvinuté pre lokalizáciu, klasifikáciu a monitorovanie biotopov Natura 2000 na území Slovenskej Republiky. Keďže ostatné členské štáty Európskej únie sa tiež zaviazali monitorovať biotopy Natura 2000 na svojom území a Slovenská vegetačná databáza, použitá na vývoj našich metód a softvéru, je kompatibilná s databázami používanými v ostatných krajinách, naše metódy a softvér budú kompatibilné s Európskym vegetačným archívom a majú tak silný potenciál využitia pre identifikáciu a monitorovania chránených území prinajmenšom v európskom priestore.
Doba trvania: 1.7.2017 – 30.6.2021
Interakcie oxidu dusnatého, fytohormónov a aktívnych foriem kyslíka v odpovedi koreňa jačmeňa na ťažké kovy
Nitric oxide, phytohormones and reactive oxygen species interactions in barley root responses to heavy metals
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Tamás Ladislav PhD.
Anotácia: Prežitie suchozemských rastlín závisí od vysoko koordinovaných signalizačných mechanizmov, ktorými prispôsobujú svoju morfológiu a metabolizmus stále sa meniacemu prostrediu. Je dobre známy fakt, že hormóny a aktívne formy kyslíka (AFK) hrajú kľúčovú úlohu v regulácii stresových odpovedí rastlín. V posledných rokoch sa pri viacerých druhoch rastlín potvrdilo, že za rôznych stresových podmienok je signálna dráha oxidu dusnatého (NO) zahrnutá do modulácie AFK a hormonálnej rovnováhy. Komponenty v rámci jednej signálnej dráhy, ako aj medzi rôznymi dráhami medzi sebou intenzívne interagujú a integrujú vnútorné ontogenetické a vonkajšie signály do morfogénnych a metabolických odpovedí, aby sa maximalizovali šance na prežitie aj v extrémnych podmienkach. Za účelom lepšieho pochopenia úlohy NO v interakcii hormónov a AFK cieľom predkladaného projektu je analýza potenciálnych súvislostí medzi NO, AFK a hormónmi v regulácii odpovedí indukovaných ťažkými kovmi v koreňových apexoch jačmeňa.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
Mäsožravé rastliny – perspektívny zdroj génov pre hydrolytické enzýmy s antifungálnym potenciálom
Carnivorous plants – prospective source of genes for hydrolytic enzymes with antifungal potential
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Libantová Jana CSc.
Anotácia: Chitinázy hrajú úlohu vo vývine a fyziológii rastlín ako aj v odpovedi na stres. Modelovým objektom v projekte je mäsožravá rastlina Drosera rotundifolia L., z ktorej sme izolovali gén kódujúci chitinázu (DrChit) zapojený do procesov trávenia koristi. Keďže k degradácii chitínovej bunkovej steny dochádza aj pomocou chitináz exprimovaných počas obranných reakcií, DrChit predstavuje potenciál z hľadiska využitia v biotechnológiách zameraných na zvýšenie odolnosti rastlín. Cieľom projektu je izolácia a purifikácia DrChit proteínu a následne jeho biochemická charakteristika a určenie antifungálneho potenciálu. Ďalej chceme izolovať aj ďalšie gény zapojené do procesov trávenia a vyhodnotiť ich expresný profil. V kontexte výskumu úlohy chitináz v obrane a vývine rastlín využijeme embryogénne kultúry ihličnanov, u ktorých vyhodnotíme vplyv stresu na expresiu chitináz v in vitro podmienkach. Očakávame, že výsledky prispejú k tvorbe stratégií zvýšenia odolnosti rastlín voči stresu metódami génového inžinierstva.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2019
Mikropropagácia a kryoprezervácia menej známych druhov drobného ovocia
Micropropagation and cryopreservation of less known small fruit species
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Gajdošová Alena CSc.
Anotácia: Bobuľové ovocie je charakteristické vysokou nutričnou hodnotou a zaraďujeme ho medzi nutraceutiká. Napriek vzrastajúcemu záujmu o drobné ovocie na trhu, jeho pestovanie nie je na Slovensku rozšírené kvôli nedostatku sadbového materiálu širšieho sortimentu odrôd a jeho vysokej cene. Rýchle a ekonomicky výhodné klonálne množenie sadbového materiálu ponúka využitie pletivových kultúr. Projekt bude zameraný i) na vývoj postupov mikropropagácie vybraných introdukovaných menej známych druhov drobného ovocia (Vaccinium, Rubus, Lonicera a Amelanchier spp.) využiteľných pri masovom množení sadbového materiálu; ii) na vypracovanie protokolu pre dlhodobé uchovávanie genetických zdrojov drobného ovocia pomocou kryoprezervácie a iii) na testovanie genetickej stability in vitro získaných rastlín a rastlín regenerovaných po kryoprezervácii pomocou molekulárnych markerov, čo umožní zhodnotiť vhodnosť vypracovaných protokolov pre ich následnú aplikáciu v rutinnej propagácii a pri dlhodobom uchovávaní genetických zdrojov.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Molekulárne metódy v šľachtení prirodzene bezlepkového amarantu
Molecular methods in breeding of naturally gluten free amaranth
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Hricová Andrea PhD.
Anotácia: Efektívne a tzv. high-throughput metódy súčasnej biológie výrazne skracujú šľachtiteľský proces a umožňujúveľmi detailne charakterizovať vzácny východiskový šľachtiteľský materiál získaný pomocou modernýchbiotechnologických postupov. V konečnom dôsledku sa podieľajú na udržateľnom rozvoji a produkcii potravín,zvlášť v období klimatických zmien, a na uspokojení dopytu stále rastúcej svetovej populácie. Spojenie takýchtoprístupov prispeje k rozšíreniu poznatkov o genóme a proteóme amarantu (Amaranth sp.), ako prirodzenebezlepkovej pseudocereálie, ktorá sa pre svoje výnimočné nutričné a dietetické atribúty stáva vo výžive čorazvýznamnejšou. Hlavným zámerom projektu je detailná charakterizácia prvej na Slovensku vyšľachtenej odrodyamarantu PRIBINA, ako aj ďalších mutantných línií získaných v predchádzajúcom výskume pomocoumutačného šľachtenia.Cieľom je na základe pozitívne zmenených vlastností vyselektovať línie, ktoré by boli postúpené do odrodovýchskúšok a následne registrované ako nové odrody.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2018
Odkrývanie procesov zodpovedných za súčasný geografický areál symbiotických organizmov s Mediteránnym rozšírením
Unraveling processes responsible for the contemporary geographic range of symbiotic organisms with Mediterranean distribution
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Bérešová Anna PhD.
Anotácia: Lichenizácia je jednou z najúspešnejších výživových stratégií v ríši húb, ktorá umožňuje lišajníkom (lichenizovaným hubám) prispôsobiť sa meniacim sa podmienkam prostredia. Cieľom projektu je zistiť, či symbiotické interakcie a ich prípadné zmeny hrajú úlohu pri formovaní distribučného areálu lišajníkov. Zameriame sa na modelové taxóny s mediteránnym rozšírením. Naším cieľom je zistiť, či rozmanitosť photobiontov zodpovedá genetickej rozmanitosti mykobionta naprieč distribučnými areálmi. Predpokladáme a budeme hľadať dôkazy javu, že zmena fotobionta je hnacím motorom pre zvyšovanie ekologickej plasticity niektorých druhov lišajníkov.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Polyploidia a alopatrická diferenciácia ako mechanizmy speciácie v čeľadi Brassicaceae
Polyploidy and allopatric differentiation as speciation drivers in the Brassicaceae family
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Španiel Stanislav PhD.
Anotácia: V projekte budeme skúmať polyploidné pôvody, fylogenetické vzťahy a evolučnú históriu v druhových komplexoch z troch rodov Brassicaceae: Alyssum, Odontarrhena, Cardamine. Naším cieľom je zovšeobecniť pozorovanú štruktúru a objasniť hlavné evolučné procesy, ktoré viedli k diverzifikácii a speciáciii v týchto polyploidných druhových skupinách. Taktiež zrevidujeme sporné druhové ohraničenia a navrhneme nové taxonomické koncepty . Bude použitá kombinácia viacerých metód: multivariačná morfometrika, stanovenie ploidnej úrovne prietokovou cytomeriou a sekvenovanie rôznych cieľových úsekov DNA (vrátane metódy vysokovýkonného sekvenovania). Taktiež vytvoríme online prístupnú karyologickú a nomenklatorickú databázu tribusu Cardamineae, ktorá môže byť základom pre ďalšie evolučné štúdie v tejto skupine. Naše štúdie prispejú k lepšiemu pochopeniu evolúcie rastlín a k efektívnej ochrane druhovej diverzity študovaných taxónov.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Prečo sú niektoré druhy úzko endemické a iné široko rozšírené? Štúdium významu biologických vlastností a genetickej variability v troch skupinách blízko príbuzných taxónov z čeľade Asteraceae
Why are some species narrowly endemic while their congeners are geographically widespread? Role of biological traits and genetic variability studied in the three groups of the closely related taxa from the family Asteraceae
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Šingliarová Barbora PhD.
Anotácia: Cieľom projektu je štúdium príčin vzácnosti druhov u troch modelových skupín z čeľade Asteraceae (agregát Tephroseris longifolia, skupina Cyanus napulifer a skupina Pilosella alpicola) porovnávaním viacerých biologických charakteristík a genetickej diverzity vzácnych (často endemických) a im blízko príbuzných bežných druhov. Použijeme kombinovaný prístup zahŕňajúci genetické analýzy vysoko variabilných molekulárnych markrov (AFLP, SSRs), analýzu rozdielov vo fitnesse, v ekologickej nike a v schopnosti šíriť sa (pestovateľské experimenty, pôdne analýzy, GIS vrstvy). Výsledky projektu prinesú jednak cenné poznatky o špecifických faktoroch určujúcich veľkosť areálu vo vybraných skupinách čeľade Asteraceae, ale tiež pomôžu nájsť spoločné črty a všeobecnejšie zákonitosti v nami odhalených procesoch. Každá zo skúmaných skupín zahŕňa aj taxóny ohrozené súčasnou ľudskou činnosťou, preto výstupy projektu budú slúžiť tiež ako východisko pre ochranárske odporúčania.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
Skríning a transformácia dát z modelových centier biodiverzity pre pochopenie ekologických a fylogenetických vzťahov vybraných vzácnych a ohrozených druhov húb
Screening and transformation of data of model centers of biodiversity for understanding of ecological and phylogenetical relationships of rare and endangered species of fungi
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Kučera Viktor PhD.
Anotácia: Huby patria medzi druhovo najbohatšie skupiny organizmov (odhad 1,5 mil. druhov) a sú tiež ohrozené ľudskými aktivitami. S ústupom druhov alebo šírením druhov sú spojene aj zmeny biodiverzity a väčšia zraniteľnosť biologických systémov. Pretože poznanie biodiverzity, rozšírenia a taxonómie vzácnych a ohrozených druhov húb môže významnou mierou prispieť k správnemu manažmentu krajiny, cieľovou skupinou sú vzácne a ohrozené huby definované v Červenom zozname. Materiál získaný v modelových centrách biodiverzity bude spracovaný morfometrickými i molekulárnymi metódami. Spoločný výskum umožní zdieľať prístrojové vybavenie partnerských inštitúcii a výchovu mladých vedeckých pracovníkov v metódach terénnej a analytickej práce. Získané výsledky budú uverejnené vo vedeckých periodikách a na konferenciách a využijú sa aj pre zlepšenie manažmentu biotopov a ako podklady pre selekciu "Významných mykologických území".
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
Synantropizácia lesných spoločenstiev: analýza faktorov ovplyvňujúcich výskyt nepôvodných druhov rastlín v lesoch
Synanthropisation of the forest communities: Analysis of factors affecting distribution of alien plants in forests
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jarolímek Ivan CSc.
Doba trvania: 1.1.2015 – 31.12.2018
Systematika a fylogenéza rodu Dermoloma v Európe a Severnej Amerike
Systematics and phylogeny of the genus Dermoloma in Europe and North America
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Adamčík Slavomír PhD.
Anotácia: Dermoloma je nedostatočne známy rod klobúkatých bazídiových húb patriaci do radu Agaricales (Agaricomycotina). Celosvetovo je v tomto rode opísaných viac než 30 druhov, ale len málo z nich sa vo všeobecnosti akceptuje. Názory na morfologické ohraničenie a počet druhov sa v súčasnej literatúre rôznia. V Európe sa tradične rozlišuje tri až osem druhov, hoci počet opísaných druhov presahuje dvadsať. Naša predbežná fylogenetická štúdia naznačuje existenciu viac ako 25 molekulárnych operačných jednotiek v Európe, ktoré pravdepodobne predstavujú samostatné druhy. Cieľom navrhovaného projektu je preto definovať európske a severoamerické taxóny rodu Dermoloma molekulárnymi aj morfologickými metódami a priradiť k nim správne mená. Huby rodu Dermoloma sú dôležitou súčasťou travinných spoločenstiev a preto sa chceme venovať aj otázke analýz environmentálnych pôdnych vzoriek a hľadať vhodný barcode na odlíšenie druhov za pomoci next generation sequencing (metagenomics).
Doba trvania: 1.1.2018 – 31.12.2021
Štúdium funkcie génov dehydrínov z Arabidopsis thaliana pri tolerancii voči vybraným typom abiotického stresu
Studying of the function of dehydrin genes from Arabidopsis thaliana in the tolerance to selected types of abiotic stresses
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Moravčíková Jana PhD.
Anotácia: V dôsledku meniaceho sa životného prostredia sú rastliny čoraz viac vystavované rôznym typom abiotického stresu ako napr. sucho, zasolenie, nízka teplota alebo prítomnosť ťažkých kovov. Súčasťou odpovede rastlín natakýto stres je modulácia obrany bunkového metabolizmu a produkcia celej rady proteínov, medzi ktoré patria aj dehydríny. Dehydríny sú hydrofilné proteíny, ktoré sa indukujú hlavne v dôsledku nízkej teploty alebo dehydratácie; mechanizmy ich pôsobenia však nie sú objasnené. Práca je zameraná na štúdium vplyvu konštitutívnej expresie génov dehydrínov z A. thaliana At1g54410, At2g21490 a At3g50970 na toleranciu transgénnych rastlín tabaku voči vybraným typom abiotického stresu a ich kombinácie. Štruktúry týchto dehydrínov obsahujú oblasti bohaté na histidín, ktoré by pre schopnosť viazať voľné kovy mohli prispieť aj k zvýšenej tolerancii voči ťažkým kovom. Zároveň budeme študovať do akej miery overexpresia dehydrínových génov vstupuje do interakcie s inými komponentmi obrannej reakcie rastliny.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2019
PLADEFNUT – Štúdium vplyvu rôznych nutričných podmienok na akumuláciu toxických elementov v pšenici
Studying the effect of different nutritional conditions on the accumulation of toxic elements in wheat
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Moravčíková Jana PhD.
Anotácia: Projekt sa zaoberá dopadom dvoch v súčasnej dobe významných environmentálnychkontaminantov na rastliny, a to prítomnosti toxických kovov, nadmerných množstiev dusíka a ich kombinácií.Oba faktory sú výsledkom vývoja priemyslu, poľnohospodárstva a chemickej výroby, ktoré sú spojené s veľkýmmnožstvom znečisťujúcich látok, predovšetkým oxidov síry, dusíka, uhlíka a emisie ťažkých kovov. Znalosti omechanizmoch rastlín obrany proti týmto faktorom sú obmedzené. Najmä účinky nadmerného hnojenia naakumuláciu kovov rastlinami, ako aj na rastliny samotné doteraz boli pomerne málo študované. Projekt budetento problém riešiť komplexne prostredníctvom štúdia kvantitatívnych a kvalitatívnych zmien v aktivitáchenzýmov antioxidatívneho systému ako aj profilov typických bielkovín rastlinnej obrany. V paralelnej línii projektubudeme charakterizovať súbor odrôd pšenice pestovaných na Slovensku z hľadiska genetického potenciáluakumulovať kadmium s využitím dostupných markerov DNA. Projekt bude vytvárať nové poznatky omolekulárnom pozadí reakcií rastlín na relatívne málo študované typy stresu. Výsledky budú vyhodnotené zhľadiska ich možného využitia ako markérov pre toleranciu /citlivosť na toxické kovy alebo nadmerné používaniehnojív. Znalosti o vplyve zvyšujúcej sa koncentrácie dusíka na rastliny a ich obranyschopnosť budú prínosné premanažment hnojenia v poľnohospodárstve. Projekt tiež prispeje k charakterizácii genofondu pšenice zoSlovenska z hľadiska zdravotného rizika pri ich pestovaní v kontaminovaných oblastiach.
Doba trvania: 1.7.2016 – 30.6.2020
Štúdium vplyvu sekretómu na zvýšenie embryogénnej kapacity pri vybraných druhoch ihličnanov
The study of secretome influence to increasing embryogenic capacity of selected Conifer species
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Klubicová Katarína PhD.
Anotácia: Somatická embryogenéza predstavuje účinný regeneračný systém, vhodný na štúdium základných otázok vývinu rastlín. Je považovaná aj za vhodnú metódu vegetatívneho rozmnožovania ihličnatých drevín pomocou in vitro kultúr. Napriek tomu, že proces somatickej embryogenézy bol indukovaný pri mnohých druhoch ihličnatých drevín, doteraz nie sú úplne objasnené procesy maturácie somatických embryí a regenerácie somatických semenáčov. Pokrok v pochopení procesov prebiehajúcich počas maturácie a úplnej regenerácie rastlín sú nevyhnutné na efektívne využitie regeneračného systému na in vitro rozmnožovanie ihličnanov. Cieľom navrhovaného projektu je identifikácia sekretómu embryogénnych línií s odlišnou embryogénnou kapacitou s použitím proteomických metód. Identifikované proteíny budú podkladom na navrhnutie potenciálnych markerov pre somatickú embryogenézu a charakterizácia proteínov aktívnych pri regulácii môže prispieť k lepšiemu pochopeniu procesov prebiehajúcich počas somatickej embryogenézy u ihličnatých drevín.
Doba trvania: 1.1.2018 – 31.12.2020
Štúdium vybraných fyziologických a molekulárnych parametrov zahrnutých v regenerácii a raste parazitických burín Phelipanche spp.
Study of selected physiological and molecular factors involved in regeneration and growth of parasitic weeds of Phelipanche spp.
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Matúšová Radoslava PhD.
Anotácia: Parazitické buriny Phelipanche, Orobanche a Striga spp. patria k ekonomicky významným rastlinným patogénom s negatívnym vplyvom na produkciu poľnohospodárskych plodín. Škody na úrode spôsobené parazitickými burinami ročne dosahujú viac než 7 biliónov dolárov. Tieto parazitické rastliny po vyklíčení spoja svoj koreňový systém s koreňmi hostiteľských rastlín a z nich čerpajú vodu a živiny. V súčasnosti nie je známa účinná metóda ich eliminácie. Preto sa jedna z línií výskumu zameriava na získanie poznatkov o génoch a mechanizmoch, ktoré sa podieľajú na interakcii medzi parazitickými rastlinami a ich hostiteľmi. Všeobecným cieľom projektu bude štúdium faktorov ovplyvňujúcich rast a regeneráciu Phelipanche spp. v podmienkach in vitro a v spojení s hostiteľom, ktoré v nadväznosti na transformačné protokoly Phelipanche spp. umožnia skúmať funkciu génovpodieľajúcich sa na interakcii parazit-hostiteľ a napomôcť pri navrhovaní novej (selektívnej) kontroly parazitických burín.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Taxonomická a nomenklatorická revízia diverzity cievnatých rastlín Slovenska
Taxonomic and nomenclatural revision of diversity of vascular plants of Slovakia
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Letz Dominik Roman PhD.
Anotácia: Hlavným cieľom projektu je dôkladná taxonomická, nomenklatorická a chorologická revízia diverzity cievnatých rastlín Slovenska, ktorej výsledkom bude nový referenčný zoznam taxónov, dôležitý ako štandard nielen pre botanické a iné vedné odbory, ktoré prichádzajú do kontaktu s cievnatými rastlinami, ale aj pre legislatívu, ochranu prírody, poľnohospodárstvo a lesníctvo. Revízia kriticky zohľadní všetky doterajšie poznatky o flóre Slovenska, ako aj posledné objavy vo fylogenéze a taxonómii rastlín. Zoznam bude kompatibilný so súčasným zoznamom Európy a mediteránnej oblasti (Euro+Med PlantBase) a inými medzinárodnými štandardami. V rámci projektu sa budú riešiť aj viaceré nomenklatorické otázky, čo vyústi do publikovania článkov v medzinárodných časopisoch. Webový portál, ktorý sa vytvorí v súvislosti v novým zoznamom, bude jednoduchým prístupovým miestom nielen k informáciám o akceptovaných menách a synonymách, ale aj k slovenskému názvosloviu a ďalším údajom.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Transkripčná, posttranskripčná a posttranslačná regulácia génu IRT1, rozhodujúceho transportéra železa v koreni rastlín
Transcriptional, post-transcriptional and post-translational regulation of IRT1 gene, a key transporter of iron in plant roots
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Doc. RNDr. Jásik Ján CSc.
Anotácia: Pomocou transgénnych a mutantných línií v kombinácii so súčasnými genetickými, molekulárno-biologickými, histochemickými, imunologickými, fluorometrickými, chemicko-analytickými a mikroskopickými metódami chceme charakterizovať či, a ako sa prítomnosť alebo absencia železa a iných kovových prvkov prenášaných IRT1 proteínom prejaví na aktivite IRT1 promótora, procese zostrihu RNA, lokalizácii, obmene a vnútrobunkovej dynamike IRT1 proteínových foriem v koreňoch modelového organizmu arábkovky Thalovej (Arabidopsis thaliana). Výskum mnohoúrovňovej regulácie IRT1 génu a súčasné monitorovanie obsahu a distribúcie železa a iných kovových prvkov v rastlinách prinesú cenné informácie pre biotechnologické aplikácie za účelom obohatenia rastlín železom a/alebo obmedzenia absorpcie potenciálne toxických kovových prvkov. Poznatky sa môžu využiť v poľnohospodárskej šľachtiteľskej praxi na získanie výnosnejších rastlín a tolerantnejších odrôd k ekologickým záťažiam ktoré sú spôsobené ťažkými kovmi.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Vplyv interakcií voľnej žijúcich bylinožravcov a vegetácie na procesy vo vysokohorských ekosystémoch
The Effects of Interactions Between Wild Herbivores and Vegetation on Processes in Alpine Ecosystems
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Šibík Jozef PhD.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
Vplyv krajiny a regulácií na spoločenstvá bentosu tečúcich vôd.
Impact of regulations of the country and the communities benthos flowing water
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Illýová Marta PhD.
Anotácia: Predmetom projektu je zistiť vývoj vplyvu abiotických a biotických faktorov v pôvodných a degradáciou ovplyvnených tokoch riečnej krajiny. Ako modelové objekty výskumu boli navrhnuté pôvodné horské a podhorské toky, ako aj toky postihnuté veternou kalamitou a odlesnením. Zameriame sa na stanovenie mikrohabitatových preferencií vybraných taxónov. Ako aj vyhodnotenie dlhodobého vývoja veľkých slovenských riek a ich ovplyvnenie reguláciami na úrovni druhov a ich ekologických charakteristík (riečne kontinuum a diskontinuum). Chceme skúmať účinky hydroklímy na teplotný režimu toku a teplotnú preferenciu vodných organizmov. Zameriame sa na hierarchicky rôzne spektrum vodných organizmov – fytobentos, mikrozoobentos, makrozoobentos a ryby. Ďalej na vybrané izotopy chemických prvkov v hydrobiontoch a ich potrave, v rôznom geologickom a ekologickom prostredí, ekologické metriky, indexy tokov riečnej nivy, druhové charakteristiky afylogenetické vzťahy makrozoobentosu.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
Vplyv kremíka a kyseliny salicylovej na fyziologické a biochemické procesy rastlín kukurice vystavených stresu z antimónu (Sb) a niklu (Ni)
Effect of silicon and salicylic acid on physiological and metabolical processes in maize plants stressed by antimony (Sb) and nickel (Ni)
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Luxová Miroslava CSc.
Anotácia: Znečisteniu životného prostredia ťažkými kovmi sa venuje zvýšená pozornosť niekoľko posledných desaťročí.Jedným z potenciálnych kontaminantov životného prostredia je antimón, ktorý sa vo väčšom množstve dostáva do životného prostredia antropogénnou činnosťou. Nikel je považovaný za esenciálny prvok, ktorý je však vo vyššej koncentrácii toxický pre väčšinu rastlín. Do pôdy sa dostáva z čistiarenských kalov, priemyselného odpadu a atmosférického spádu. V predkladanom projekte budeme sledovať odpovede testovaných rastlín (kukurica siata) na úrovni produkčnej (biomasa), biochemickej (tvorba reaktívnych foriem kyslíka a aktivita antioxidačných enzýmov) a fyziologickej (poškodenie membrán, zmena obsahu a expresie proteínov) na stresové podmienky (Sb a Ni). Ďalej sa zameriame na kvantifikáciu potenciálnych amelioračných účinkov exogénne aplikovaného kremíka a/alebo kyseliny salicylovej, o ktorých je z literatúry známe, že vo vhodných koncentráciách zlepšujú rast rastlín.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Využitie kremíka pri potlačení invázie fytopatogénnych húb do koreňov rastlín
Silicon-mediated inhibition of fungal phytopathogen invasion into the plant roots
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Luxová Miroslava CSc.
Anotácia: Cirok dvojfarebný je celosvetovo piatou najviac kultivovanou obilninou s potravinárskym a technickým využitím. Kvantitu a kvalitu produkovanej biomasy výrazne ovplyvňujú hubové ochorenia. Cieľom projektu je zistiť, či aplikácia kremíka dokáže zvýšiť obranyschopnosť koreňov ciroku voči fytopatogénnej hube, či už špecifickou depozíciou kremičitanových agregátov alebo cez zmenu metabolizmu koreňov rastlín. Po selekcii vhodných genotypov hostiteľa a patogéna sa budú zisťovať invázne vlastnosti huby, produkcia biomasy hostiteľa, tvorba reaktívnych foriem kyslíka, antioxidačných enzýmov, ich aktivít, obsah a lokalizácia kremíka v hostiteľovi a kvantifikovať potenciálne amelioračné účinky kremíka. Očakávané prospešné účinky kremíka pri potlačení negatívnych vplyvov pri interakciách rastlinný hostiteľ – fytopatogénna huba budú využiteľné v poľnohospodárskej praxi pri ochrane tejto kultúrnej plodiny pred napadnutím fytopatogénom pomocou aplikácie kremíka
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019
MASnPNO – Využitie myrozinázy na aktiváciu sulforafanu pre vývoj preparátu s preventívnymi účinkami nádorových ochorení
The application of myrosinase for sulforaphane activation in development of a novel product exhibiting cancer prevention effects
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Salaj Ján DrSc.
Anotácia: U sulforafanu sa overili preventívne účinky proti vzniku a rozvoju nádorových ochorení. Sulforafan je v potrave prítomný pri koncentráciách, ktoré nedosahujú účinnú hladinu. Navyše sa v prirodzenej forme prevažne vyskytuje ako neaktívny glukorafanín, preto je nutné, aby prebehla jeho aktivácia na sulforafan a ďalšie aktívne produkty. Túto premenu katalyzuje enzým, myrozináza (EC 3.2.1.147). Cieľom projektu je navrhnúť nový preparát, ktorý bude pozostávať z sulforafan-glukozinolátu a stabilizovanej myrozinazy.
Doba trvania: 1.7.2017 – 30.6.2021
Zmeny biodiverzity v urbánne fragmentovanej krajine
Changes in biodiversity in an urban fragmented landscape
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Čejka Tomáš PhD.
Anotácia: Projekt sa zaoberá zmenami biodiverzity v mestskom prostredí, a to v priestore (ekologické gradienty, fragmentácia) aj v čase (hist. údaje). Pre štúdium sme zvolili dve, ekologicky významne previazané modelové skupiny: cievnaté rastliny a mäkkýše. Na základe výskumu týchto modelových organizmov budeme riešiť 5 hlavných okruhov problémov: [1] Do akej miery sa uplatňujú princípy ostrovnej ekológie v modelovom území a aký je vplyv fragmentácie a jednotlivých faktorov prostredia na štruktúru a variabilitu bioty; [2] Či a do akej miery sa líši genet. diverzita populácií vybraných modelových druhov v dlhodobo súvislo zalesnených oblastiach a v neorefúgiách; [3] Ako vplýva mestské prostredie v čase a priestore na diverzitu pôvodných druhov a prenikanie nepôvodných druhov do lesných fragmentov; [4] Na základe teórie refúgií overiť aká je ekologická a ekosozologická štruktúra bioty vo zvyškoch lesnej vegetácie; [5] Či dochádza k biotickej homogenizácii a ktoré skupiny bioty sú biot. homogenizáciou postihnuté najviac.
Doba trvania: 1.1.2018 – 31.12.2021
Život na hranici zániku – možnosti zachovania halofytov vo flóre Slovenska
Life on the border of extinction – surviving potential of halophytes in Slovakia
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Dítě Daniel PhD.
Doba trvania: 1.1.2016 – 31.12.2019