Projektová činnosť

Medzinárodné

MOBILISE – Mobilizácia dát, pravidiel a expertov vo vedeckých zbierkach
Mobilising Data, Policies and Experts in Scientific Collections
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Marhold Karol CSc.
Anotácia: Európske zbierky z oblasti prírodných vied obsahujú približne 1,5 miliardy biologických a geologických objektov, ktoré predstavujú približne 80% známej súčasnej a minulej biologickej a geologickej diverzity na Zemi. Cieľom projektu je pripraviť pôdu pre budúci celoeurópsky distribuovaný systém vedeckých zbierok. Konkrétne ciele projektu sú: (1) Uľahčiť prenos poznatkov a technológií medzi výskumníkmi, špecialistami v oblasti domén, agregátormi údajov a priemyslom prostredníctvom aktivít na vytváranie sietí, podujatí, workshopov a školení; (2) Podporovať vývoj inovačných techník a koordinované stanovovanie priorít s cieľom zvýšiť efektívnosť rozsiahlej digitalizácie a mobilizácie existujúcich dát; (3) Zvýšiť povedomie o potrebe vedy pre spoločnosť, o tom, že okrem fyzického prístupu sú infraštruktúry udržateľného prístupu k údajom neoddeliteľnou súčasťou výskumu biodiverzity.
Doba trvania: 1.10.2018 – 1.10.2022
KEW – Uchovanie endemickej flóry Karpát
Conserving the endemic flora of the Carpathian region
Program: Iné
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Kučera Jaromír PhD.
Anotácia: Projekt zastrešuje aktivity týkajúce sa zberu semien a výskumných aktivít vyšších druhov rastlín na území Karpát so špeciálnym zameraním na endemické, subendemické a regionálne ohrozené druhy nachádzajúce sa na hranici svojho areálu rozšírenia. V roku 2017 sa vytvorila sieť „Carpathians research network“ spájajúca expertov z piatich krajín. Projekt je koordinovaný našou inštitúciou a financovaný RGB Kew. Hlavnými cieľmi projektu sú: ex situ konzervácia semien v semmených bankách; biosystematické štúdie vybraných karpatských endemických druhov a skupín (bolo vybraných päť rôznych modelových rodov, ktoré zahrňujú karpatské endemity – Carex curvula agg., D. arbuscula Čelak. and D. petraea Leyb., Soldanella L.: sect. Soldanella, Draba L.: sect. Aizopsis, sect. Chrysodraba and sect. Leucodraba, Silene zawadzkii Herbich), vytvorenie detailnej databázy rozšírenia celej endemickej flóry Karpát a publikácia monografie Flora Endemica Carpatica.
Doba trvania: 1.1.2019 – 30.6.2022

Národné

POLYPLOID – Pôvod polyploidných komplexov: úloha polyploidizácie a geografickej a ekologickej izolácie
The origin of polyploid complexes: the role of polyploidization, geographical and ecological isolation
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Marhold Karol CSc.
Anotácia: Témou predkladaného projektu sú mikroevolučné a speciačné procesy v diploidno-polyploidných komplexoch patriacich do čeľade Brassicaceae. Budeme skúmať speciáciu na diploidnom aj polyploidnom stupni, pričom chceme objasniť úlohu spájania a duplikácie genómov ako aj geografickej a ekologickej separácie. Kladené otázky majú širší význam, nad rámec študovaných rodov, a odpovede pomôžu lepšie porozumieť základným procesom polyploidnej speciácie ako takej. Metódy, ktoré budeme používať zahŕňajú štandardné markery využívané v molekulárnej systematike, ako aj metódy založené na sekvenovaní novej generácie, konkrétne RAD-seq („restriction site associated DNA sequencing“, sekvenovanie DNA v oblasti reštrikčných miest) a Hybseq (metóda kombinujúca cielené obohatenie nízkokópiových génov a „genome skimming“, sekvenovanie genómu s nízkym pokrytím, čím sa získajú najmä sekvencie ktoré sú prítomné v mnohých kópiách). Predpokladáme, že s využitím kombinácie početných markerov dôkladnejšie prenikneme do študovaných komplexov druhov a získame vyššiu robustnosť našich výsledkov. Ako komplementárne metódy použijeme prietokovú cytometriu, morfometriku a analýzu ekologických a klimatických ník. Na dosiahnutie cieľov sme vybrali štyri rody z troch rôznych tribusov čeľade Brassicaceae (Alysseae [Alyssum, Odontarrhena], Camelineae [Arabidopsis], Cardamineae [Cardamine]), ktoré reprezentujú rôzne evolučné línie v tejto čeľadi. Využijeme výhodu množstva metód, ktoré sú dostupné a už testované na blízko príbuznom rode Arabidopsis, naše dlhoročné skúsenosti s navrhovanými študovanými rodmi a taktiež už zozbieraný rastlinný materiál.
Doba trvania: 1.8.2018 – 31.7.2022
Taxonomická a nomenklatorická revízia diverzity cievnatých rastlín Slovenska
Taxonomic and nomenclatural revision of diversity of vascular plants of Slovakia
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Letz Dominik Roman PhD.
Anotácia: Hlavným cieľom projektu je dôkladná taxonomická, nomenklatorická a chorologická revízia diverzity cievnatých rastlín Slovenska, ktorej výsledkom bude nový referenčný zoznam taxónov, dôležitý ako štandard nielen pre botanické a iné vedné odbory, ktoré prichádzajú do kontaktu s cievnatými rastlinami, ale aj pre legislatívu, ochranu prírody, poľnohospodárstvo a lesníctvo. Revízia kriticky zohľadní všetky doterajšie poznatky o flóre Slovenska, ako aj posledné objavy vo fylogenéze a taxonómii rastlín. Zoznam bude kompatibilný so súčasným zoznamom Európy a mediteránnej oblasti (Euro+Med PlantBase) a inými medzinárodnými štandardami. V rámci projektu sa budú riešiť aj viaceré nomenklatorické otázky, čo vyústi do publikovania článkov v medzinárodných časopisoch. Webový portál, ktorý sa vytvorí v súvislosti v novým zoznamom, bude jednoduchým prístupovým miestom nielen k informáciám o akceptovaných menách a synonymách, ale aj k slovenskému názvosloviu a ďalším údajom.
Doba trvania: 1.1.2017 – 31.12.2020
Vplyv hybridizácie na diverzifikačné a speciačné procesy u Karpatských zástupcov rodu Soldanella
The impact of hybridisation on diversification and speciation processes in Carpathian members of the genus Soldanella
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Slovák Marek PhD.
Anotácia: Projekt bude riešiť otázky vplyvu dnešnej, ako aj historickej hybridizácie na diverzifikáciu a celkovú demografickú štruktúru horských zástupcov rodu Soldanella. V projekte sa zameriame na zástupcov rastúcich v centre diverzity rodu, konkrétne v horských regiónoch Karpát a priľahlých územiach (Sudetské pohoria, SV Alpy a pohoria východného Balkánu). Na zodpovedanie kladených vedeckých otázok použijeme kombináciu moderných metodologických a analytických postupov ako sú RAD sekvenovanie, karyologické, morfologické a ekologické analýzy. Výstupy projektu umožnia odhaliť frekvenciu a intenzitu toku génov medzi študovanými taxónmi, ako aj špecifikovať faktory a procesy, ktoré umožnili, alebo zabránili hybridizácii (introgresii) medzi dvojicami viac či menej vzdialených druhov. Mali by sme tiež objasniť, či hybridizácia prispela k nahromadeniunových genetických línií a uľahčila tým druhotvorbu v rode.
Doba trvania: 1.1.2019 – 31.12.2022