Projektová činnosť

Medzinárodné

DiSSCo Prepare – Distribuovaný systém vedeckých zbierok – prípravná fáza
Distributed System of Scientific Collections – Preparatory Phase Project
Program: Horizont 2020
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Marhold Karol DrSc.
Anotácia: Východiskom projektu európskej infraštruktúry ESFRI – DiSSCo je fakt, že európske zbierky z oblasti prírodných vied obsahujú približne 1,5 miliardy biologických a geologických objektov, čo predstavuje približne 55 % celosvetových zbierok a dokumentujú asi 80 % známej súčasnej a minulej biologickej a geologickej diverzity na Zemi. Cieľom projektu je pripraviť celoeurópsky distribuovaný systém vzájomne prepojených prírodovedných zbierok. Súčasný stav, keď zbierky sú fragmentované a informácie o nich prevažne nie sú digitalizované by sa mal zmeniť tak, aby vytvorili integrovanú dátovú paneurópsku výskumnú infraštruktúru. V rámci slovenskej účasti v európskej infraštruktúre predpokladáme, v závislosti od finančných prostriedkov z národných zdrojov, ktoré budú poskytnuté na tento ESFRI projekt, postupnú digitalizáciu všetkých botanických, mykologických a zoologických zbierkových fondov na Slovensku. Ďalej predpokladáme digitalizáciu existujúcich publikovaných údajov o rozšírení rastlín a živočíchov na Slovensku, ktoré sú v súčasnosti k dispozícii len v papierovej podobe.
Web stránka projektu: https://www.dissco.eu/prepare/
Doba trvania: 1.2.2020 – 31.1.2023
MOBILISE – Mobilizácia dát, pravidiel a expertov vo vedeckých zbierkach
Mobilising Data, Policies and Experts in Scientific Collections
Program: COST
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Marhold Karol DrSc.
Anotácia: Európske zbierky z oblasti prírodných vied obsahujú približne 1,5 miliardy biologických a geologických objektov, ktoré predstavujú približne 80% známej súčasnej a minulej biologickej a geologickej diverzity na Zemi. Cieľom projektu je pripraviť pôdu pre budúci celoeurópsky distribuovaný systém vedeckých zbierok. Konkrétne ciele projektu sú: (1) Uľahčiť prenos poznatkov a technológií medzi výskumníkmi, špecialistami v oblasti domén, agregátormi údajov a priemyslom prostredníctvom aktivít na vytváranie sietí, podujatí, workshopov a školení; (2) Podporovať vývoj inovačných techník a koordinované stanovovanie priorít s cieľom zvýšiť efektívnosť rozsiahlej digitalizácie a mobilizácie existujúcich dát; (3) Zvýšiť povedomie o potrebe vedy pre spoločnosť, o tom, že okrem fyzického prístupu sú infraštruktúry udržateľného prístupu k údajom neoddeliteľnou súčasťou výskumu biodiverzity.
Doba trvania: 1.10.2018 – 1.10.2022

Národné

POLYPLOID – Pôvod polyploidných komplexov: úloha polyploidizácie a geografickej a ekologickej izolácie
The origin of polyploid complexes: the role of polyploidization, geographical and ecological isolation
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Marhold Karol DrSc.
Anotácia: Témou predkladaného projektu sú mikroevolučné a speciačné procesy v diploidno-polyploidných komplexoch patriacich do čeľade Brassicaceae. Budeme skúmať speciáciu na diploidnom aj polyploidnom stupni, pričom chceme objasniť úlohu spájania a duplikácie genómov ako aj geografickej a ekologickej separácie. Kladené otázky majú širší význam, nad rámec študovaných rodov, a odpovede pomôžu lepšie porozumieť základným procesom polyploidnej speciácie ako takej. Metódy, ktoré budeme používať zahŕňajú štandardné markery využívané v molekulárnej systematike, ako aj metódy založené na sekvenovaní novej generácie, konkrétne RAD-seq („restriction site associated DNA sequencing“, sekvenovanie DNA v oblasti reštrikčných miest) a Hybseq (metóda kombinujúca cielené obohatenie nízkokópiových génov a „genome skimming“, sekvenovanie genómu s nízkym pokrytím, čím sa získajú najmä sekvencie ktoré sú prítomné v mnohých kópiách). Predpokladáme, že s využitím kombinácie početných markerov dôkladnejšie prenikneme do študovaných komplexov druhov a získame vyššiu robustnosť našich výsledkov. Ako komplementárne metódy použijeme prietokovú cytometriu, morfometriku a analýzu ekologických a klimatických ník. Na dosiahnutie cieľov sme vybrali štyri rody z troch rôznych tribusov čeľade Brassicaceae (Alysseae [Alyssum, Odontarrhena], Camelineae [Arabidopsis], Cardamineae [Cardamine]), ktoré reprezentujú rôzne evolučné línie v tejto čeľadi. Využijeme výhodu množstva metód, ktoré sú dostupné a už testované na blízko príbuznom rode Arabidopsis, naše dlhoročné skúsenosti s navrhovanými študovanými rodmi a taktiež už zozbieraný rastlinný materiál.
Doba trvania: 1.8.2018 – 31.7.2022