Oddelenie experimentálnej biológie rastlín

Cieľom vedeckej práce Oddelenia experimentálnej biológie rastlín je štúdium fyziologických, biochemických a molekulárnych procesov prebiehajúcich v rastlinách. Zameriavame sa na pochopenie odpovedí rastlín na stresové podmienky prostredia a poznávanie mechanizmov ich adaptácie na nepriaznivé podmienky, s dôrazom na abiotický stres. Oddelenie má k dispozícii laboratóriá pre prácu s proteínmi a nukleovými kyselinami, na analýzu génovej expresie na rôznej úrovni, na štúdium kinetiky enzýmov, laboratórium pre štruktúrnu a ultraštruktúrnu analýzu buniek, priestory na kultiváciu rastlinného materiálu.

Oblasti výskumu

V rámci rastlinnej molekulovej a bunkovej biológie sa skúma

  • úloha rastlinných synaptotagmínov v odpovediach na stres,
  • mnohoúrovňová regulácia transportérov železa
  • polarita rastlinných buniek

Skúmajú sa aj odpovede koreňov rastlín na stres

  • štúdium funkcie a vzájomných interakcií reaktívnych foriem kyslíka a dusíka, ako aj auxínu, v koreňoch vystavených stresu z kovov.

Výskum je tiež zameraný na sledovanie potenciálu kremíka (Si) na zmiernenie abiotického stresu, spôsobeného predovšetkým nadbytkom kovov a polokovov pri kultúrnych rastlinách

Laboratórium abiotického stresu

  • Laboratórna sušička VWR Dry Lne 115
    Laboratórna sušička VWR Dry Line 112 Prime
    Laboratórna sušička VWR KC-65
    Horizontálna elektroforetická aparatúra Mini Sub-Cell GT Biorad
    Zdroj elektrického prúdu pre elektroforézu Biorad PowerPac Basic
    Zdroj elektrického prúdu pre elektroforézu Consort EV265
    Vertikálna elektroforetická aparatúra s modulom na blotovanie Mini PROTEAN Tetra cell 1-D 2x
    Semidry blotovacia aparatúra Thermo Scientific OWL HEP-1
    Trepačka Heidolph Polymax 1040
    Trepačka Witeg SHR -2D
    Mini trepačka pre imunologické stanovenia Biosan PSU-2T
    Vortex VWR Lab Dancer 3x
    Vortex Biosan Multispeed MSV-3500
    Magnetické miešadlo Heidolph MR Hei-Mix S
    Magnetické miešadlo s ohrevom IKA RH basic
    Magnetické miešadlo s ohrevom Chromservis M2-A
    Suchý termostat Biosan Bio TBD-100
    Vodný kúpeľ Julabo SW 22
    Eppendorf centrifúga 5427-R
    Minicentrifúga MiniSpin plus, Eppendorf
    Minicentrifúga Witeg CF-5
    Destilačný prístroj ELGA Micra na deionizovanú vodu
    Analytické váhy Sartorius Entris 224I-1S
    Analytické váhy Sartorius MC1 AC 120 S
    Presné laboratórne váhy Mettler PM 1200
    Presné laboratórne váhy Radwag PS 600 C2 2x
    Presné laboratórne váhy Radwag PS600.R2
    pH meter Eutech CyberScan 510
    pH meter Eutech pH700
    Konduktometer Eutech CON700
    Konduktometer Radelkis OK-102/1
    Germicídny žiarič Prolux G M55W/SP-DO
    Digitálny fotoaparát Panasonic Lumix DMC-GX80

Laboratórium molekulovej a bunkovej biológie

  • konfokálny mikroskop Fluoview FV1000, Olympus (obsahuje Olympus BX 61, Olympus U-RFL-T, Olympus FV5-LDPSU, Olympus BX - UCB)
    Vodný kúpeľ Wisd witeg - Digital Fuzzy Control System
    Thermo shaker TS - 100, Biosan
    Dry Block Thermostat TDB 120, Biosan
    Termocykler - Mastercycler gradient, Eppendorf
    Fluoroscan Ascent FL, Thermo Electron Corporation
    centrifúga - TGL - 16 MC Benchtop Hight - speed Refrigerated Centriuge
    centrifúga - Micro 200, Hettich Zentrifugen
    vortex - Digital Vortex Mixer, Ohaus
    vortex - Multi Vortex V 32, Biosan
    vortex - Ika Vortex, GENIUS 3, Ika
    minicentrifúga- MiniSpin plus, Eppendorf
    minicentrifúga - Frontier 5306, Ohaus
    centrifúga - Frontier 5515 R, Ohaus
    Vertikálna elektroforetická aparatúra s modulom na blotovanie - Mini Protan Tetra cell with Blotting Module, BioRad
    Vertikálna elektroforetická aparatúra s modulom na blotovanie - omniPage Mini Tetrad , Cleaver Scientific
    Horizontálne elektroforetické aparatúry - kuroGEL, VWR Collectio
    Stereolupa M7A- Wild Heerbrugg
    orbital shaker Incubator ES 20, Biosan
    Blue Light LED transiluminator
    Cryo-cut II Microtome, Reichert – Jung
    Magnifax 3a, Meopta
    Parný autokláv STE-23-M, Icanclave
    Sušiareň s nútenou ventiláciou, Binder
    Conviron model G30
    Hlbokomraziaci box -80°C, Arctiko
    Laminárny box - MSC Advantage, Thermo Scientific
    ultramikrotóm - ULTRACUT E, Reichert – Jung
    ultramikrotóm - LKB 8800 Ultramicrotome III, Broma
    prístroj na zhotovovanie nožov - LKB 7800 Knifemaker, Bromma
    probenator B 7925
    mikrotóm MPS*2
    Multirotátor - Multi Bio RS 24, Biosan
    Orbital shaker Incubator ES 20, Biosan
    Multi-function Orbital Shaker PSU - 20i, Biosan
    Fiveeasy ph meter f20-STD-KIT, METTLER TOLEDO
    Polymerizačný prístroj KT 100 - c. reicheut, austria
    váhy mettler AE 240
    Magnetické miešadlo s tepelným ohrevom, MSH-300, Biosan

Laboratórium odpovedí koreňov rastlín na stres

  • Chemilumino/Spectrofluorometers
    Electrophoresis and blotting systems
    Fast performance liquid chromatograph
    Fluoro/stereomicroscopes
    PCR apparat
    Ultra/centrifuges